对相关事件所产生的两岸效应，施威全表示，由于金厦水域本来就有高度两岸政治性质，因此观察两岸官方的处置，无论在言语、行为上都有分寸，两边政府都有意识到，相关事件可以导致潜在的激烈冲突风险，双方都不希望往这方面走。
他举例，大陆方面虽然在事件发生后，公开否认金厦有“禁、限制水域”，大陆海警并随即展开常态性巡查，并拦截金门观光游艇实施登检，但相关举措是在金门的“禁止水域”范围之外，也就是说，海警船仍没有进到“禁、限制范围”。另外，虽然有大陆海监船进到“禁、限制水域”，但毕竟性质与海警船不同，是隶属自然资源部，并不是人民武装警察部门，非武装船舰，且在台湾海巡警告之后，就退出界外。
施威全表示，上述情况显示出，陆方的作为是非常仔细考量之下的行动；台湾方面也目前其实是重申法律立场，也没有往前进一步，“海洋委员会”、“海巡署”都强调执法面，将焦点锁定在执法意外，没打算上纲到政治事件，陆委会也退居二线，台湾官方在相关事件上面无意去突出两岸政治定位争议。
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